以辣椒品种鸡爪×吉林为材料，采用穴施方法，研究微生物菌剂对连作地块辣椒生长和微生物群落的影响。结果表明，微生物菌剂在一定程度上促进了辣椒的生长，植株的株高、茎粗、果长、果宽和产量等指标均显著高于对照，其中产量增加幅度最大，较对照显著提高了14.76%。施用微生物菌剂提高了土壤中真菌和细菌相对物种数量和OTU数量；通过KEGG代谢途径分析，发现代谢通道是差异功能最显著富集的通路，相对丰度高达近80%。综上，微生物菌剂能够改善土壤真菌和细菌群落结构，促进辣椒植株的生长，提高辣椒产量。